Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCAP01258 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCAP01258 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCAP01258 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms