Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC2O95714 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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