Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF40O75150 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF40O75150 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms