Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA5O60264 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms