Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF3O43395 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms