Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLIC2O15247 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC2O15247 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms