Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN3O00409 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms