Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN6O00399 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN6O00399 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms