Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3KR12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3KR12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KR12 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KR12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KR12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KR12 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms