Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms