Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E5RI56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E5RI56 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E5RI56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E5RI56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E5RI56 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E5RI56 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E5RI56 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E5RI56 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E5RI56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E5RI56 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms