Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L9A6NEM1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms