Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms