Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms