Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC027045.2-201ENST00000634974 1571 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MFSD8-259ENST00000642042 2303 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 KRTAP9-8-201ENST00000254072 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SAA2-201ENST00000256733 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PRG3-201ENST00000287143 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MED18-202ENST00000398997 1106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 KRTAP9-3-201ENST00000411528 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 Z84484.1-201ENST00000411643 319 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 GACAT3-201ENST00000426539 1096 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AP001476.2-201ENST00000435738 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ZNF175-202ENST00000436511 488 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL445493.2-201ENST00000442684 945 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC013480.1-201ENST00000451514 346 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ST13P15-201ENST00000460666 1107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RPS2P45-202ENST00000490535 847 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL162431.3-201ENST00000503142 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC024022.1-201ENST00000503321 598 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC139491.4-201ENST00000504629 354 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC090579.1-201ENST00000518591 504 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC090502.1-203ENST00000551726 554 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC099511.1-202ENST00000563923 491 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC138627.1-208ENST00000568137 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TRBV7-9-201ENST00000612787 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 GPC5-204ENST00000618596 960 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 Z84468.1-202ENST00000630584 667 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ABCC9-207ENST00000636888 1023 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TCF4-240ENST00000568673 2398 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LDHC-207ENST00000541669 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SEMA4D-208ENST00000422704 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DCLK3-201ENST00000416516 5344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PNPLA1-201ENST00000312917 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ZNF75BP-201ENST00000546499 1524 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC023300.3-201ENST00000623096 5025 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TRIM16L-201ENST00000395671 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TRIM16-211ENST00000577886 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AP005058.1-201ENST00000580193 2975 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 C10orf126-201ENST00000375520 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC104134.1-201ENST00000413234 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LINC00298-201ENST00000426969 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 C8orf86-201ENST00000358138 2250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 WFDC3-203ENST00000372630 597 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC008267.2-201ENST00000411606 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC092474.1-201ENST00000416158 1167 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC245036.2-201ENST00000433549 287 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RPL6P8-201ENST00000490136 843 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC021127.1-201ENST00000503589 566 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 GCNT1P2-201ENST00000504682 595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC094104.2-201ENST00000509718 622 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TMEM185AP1-201ENST00000524311 546 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 IFITM9P-201ENST00000535743 396 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LIPM-202ENST00000539337 1197 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC025627.1-201ENST00000574267 730 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC134407.1-201ENST00000577385 709 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC012572.1-201ENST00000581634 397 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MIA-RAB4B-201ENST00000600729 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC020549.2-201ENST00000604893 508 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC233300.1-201ENST00000624323 817 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 KIR3DX1-205ENST00000610811 3325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PTPN20-202ENST00000374339 1388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC008507.5-201ENST00000624591 1969 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CYP24A1-202ENST00000395954 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MPV17-202ENST00000357186 2011 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 BVES-203ENST00000446408 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TBX22-201ENST00000373294 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RGS22-218ENST00000617334 4253 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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