Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
V9GYQ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
V9GYQ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
V9GYQ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
V9GYQ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYQ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYQ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYQ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYQ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
V9GYQ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
V9GYQ6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms