Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms