Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPS28Q9Y2Q9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms