Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms