Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms