Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA6Q9UF33 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA6Q9UF33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms