Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms