Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH10Q9P2E7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms