Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms