Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms