Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNKQ9P0W0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms