Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSRB1Q9NZV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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