Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18AQ9NYP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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