Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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