Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
DNAH9Q9NYC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DNAH9Q9NYC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms