Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms