Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SDHAF2Q9NX18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDHAF2Q9NX18 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms