Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms