Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms