Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms