Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX8Q9HC52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms