Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF41Q9H4P4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF41Q9H4P4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF41Q9H4P4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF41Q9H4P4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF41Q9H4P4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF41Q9H4P4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms