Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms