Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIPCQ9C0C6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms