Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP4Q9C0A0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms