Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms