Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms