Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MXRA8Q9BRK3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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