Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCA3Q99758 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCA3Q99758 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms