Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms