Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms