Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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