Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20AQ96MK3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms