Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCTD13Q8WZ19 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms