Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms